Главные герои отправляются в уникальное место под названием «Сумасшедшее Ранчо Q-Чуваков». Место выбрано неслучайно, ведь оно когда-то принадлежало кузену Шэгги, пропавшему без вести. Скуби-ду и команда хотят узнать, что же произошло с Тони на самом деле. Оказавшись на месте, они встречают местных жителей, которые, пугаясь Шэгги, разбегаются в разные стороны, путая его с призраком.
После того как лаборатория была уничножена, двум подопытным мышам приходится поселится у девочки Элмайры, которая покупает их в зоомагазине. И теперь у Брейна появляются еще проблемы по захвату мира: Девочка-живодер, туповатый Пинки и нехватка лабораторного оборудования.